阿图什市（辖3街道3镇4乡）：幸福路街道、光明路街道、新城街道、松他克镇、阿扎克镇、阿湖乡、格达良乡、上阿图什镇、哈拉峻乡、吐古买提乡

阿克陶县（辖7乡5镇4场1苗圃）：阿克陶镇、奥依塔克镇、玉麦镇、皮拉勒乡、巴仁乡、喀热开其克乡、加马铁热克乡、木吉乡、布伦口乡、克孜勒陶镇、恰尔隆镇、塔尔塔吉克族乡、托尔塔依农场、阿克达拉牧场、原种场、苗圃、克孜勒苏柯尔克孜、自治州林场

阿合奇县（辖1镇5乡2场）：阿合奇镇、库兰萨日克乡、色帕巴依乡、苏木塔什乡、哈拉奇乡、哈拉布拉克乡、良种场、国营马场

乌恰县（辖2镇9乡）：乌恰镇、康苏镇、黑孜苇乡、乌鲁克恰提乡、吉根乡、波斯坦铁列克乡、巴音库鲁提乡、膘尔托阔依乡、铁列克乡、托云乡、吾合沙鲁乡